|
ATLAS
Graficzne zestawienie danych zawartych w bazie KEGG, w szczególnych w jej dwóch systemach informacyjnych : PATHWAY i BRITE. Jest to mapa danego szlaku metabolicznego lub szlaków metabolicznych komórek nowotworowych
Opis ikon na tego typu mapach
Tego typu mapy mają swoje odnośniki do pozostałych baz danych w serwisie KEGG. Jest to oznaczone poprzez odpowiednie kolory:
- kolor zielony dotyczy szlaków charakterystycznych dla specyficznych organizmów i zaznaczone kolorem zielonym "boksy" mają odnośnik do genów w genomie lub całości szlaku metabolicznego
- fioletowe "boksy" to odnośniki do bazy KEGG Orthology, białe "boksy" to białka lub geny, których nie ma w bazie KEGG Orthology
- odnośniki do "All organisms in KEGG" mają fioletowe lub różowe "boksy". "Boksy" fioletowe to białka, które mają przynajmniej jeden odnośnik w bazie genów, natomiast "boksy" różowe oznaczają że dane białko ma także odnośnik jako ortolog
- białe "boksy" z numerami E.C. wewnątrz mają odnośniki do szlaków metabolicznych. W "Reference Pathway" odnośniki do baz enzymów, natomiast w "Reference Pathway (Reaction)" do odpowiedniej reakcji
- jeżeli "boksy" są zaznaczone na brązowo i wychodzą poza obręb baz danych to mają one odnośniki do baz zewnętrznych
|
|
