Serwis KEGG oprócz powiązań z wewnętrznymi bazami danych posiada odniesienia do zewnętrznych baz danych. Linki odnoszą się do baz zawierających informacje o tym samym kontekście biologicznym (gen, białko, organizm). Pozwala to na integracje informacji pochodzących z różnych źródeł. Links to Outside Databases