KEGG Reaction

KEGG HOME

WPROWADZENIE

PRZEGLĽD

STATYSTYKA

KEGG IDENTIFIERS

KEGG FTP

KEGG TOOLS


KONTAKT
Kontakt
KEGG REACTION źródło informacji o reakcjach biochemicznych

Enzyme Nomenclature- nomenklatura enzymów

KEGG REACTION Database- baza danych poświęcona reakcjom biochemicznym

KEGG REAKCJI zawiera wszystkie reakcje zaczerpnięte z KEGG enzymu i dodatkowe reakcje wzięte z KEGG szlaki metaboliczne. Każda reakcja jest identyfikowany przez numer R, takich jak R00259 dla acetylację L-glutaminian. Reakcje są związane z ortholog grup enzymów zdefiniowane przez KEGG ORTHOLOGY w bazie danych, która umożliwia zintegrowane analizy genomu (enzymu genów) i chemiczne (związek par) informacji.

Reactant Pair- jest zbiorem struktury chemicznej przemiany wzorców substrat-produkt dla par (reagentem par) w KEGG reakcji. Ogólnie rzecz biorąc, składa się z wielu reakcji reagentem par, a jedno z n ich znajduje się na szlaku metabolicznego KEGG nazywa główne pary, np. A04458 przede acetylację do reakcji.

KEGG Atom Types- rodzaje atomów

wprowadzone do wykrywania podobieństw biochemicznych przez wykresy oparte na porównaniu struktury chemicznej.

RDM Pattern- Charakteryzują strukturę chemiczną transformację wzorców związanych z reakcji enzymatycznych

Reaction Prediction- wzorce są podstawą do przewidywania reakcji danego rodzaju pary (lub par) chemicznych złożonych struktur w e-Zyme oprogramowania. Ponadto, na podstawie obserwacji, że konkretne modele są wyjątkowo RDM lub preferencyjnie w szczególnych kategorii KEGG szlaki metaboliczne.

Autorzy:

Zbigniew Jakub Bidas,Karolina Osowiecka,Jarosław Piotrowski,Paweł Podliński,Piotr Tyszer