KEGG REACTION
źródło informacji o reakcjach biochemicznych
Enzyme Nomenclature- nomenklatura enzymów
KEGG REACTION Database- baza danych poświęcona reakcjom
biochemicznym
KEGG REAKCJI zawiera wszystkie reakcje zaczerpnięte z KEGG
enzymu i dodatkowe reakcje wzięte z KEGG szlaki metaboliczne.
Każda reakcja jest identyfikowany przez numer R, takich jak R00259
dla acetylację L-glutaminian. Reakcje są związane z ortholog grup
enzymów zdefiniowane przez KEGG ORTHOLOGY w bazie danych,
która umożliwia zintegrowane analizy genomu (enzymu genów) i chemiczne
(związek par) informacji.
Reactant Pair- jest zbiorem struktury chemicznej przemiany wzorców
substrat-produkt dla par (reagentem par) w KEGG reakcji. Ogólnie rzecz
biorąc, składa się z wielu reakcji reagentem par, a jedno z n
ich znajduje się na szlaku metabolicznego KEGG nazywa główne pary,
np. A04458 przede acetylację do reakcji.
KEGG Atom Types- rodzaje atomów
wprowadzone do wykrywania podobieństw biochemicznych przez wykresy
oparte na porównaniu struktury chemicznej.
RDM Pattern- Charakteryzują strukturę chemiczną transformację
wzorców związanych z reakcji enzymatycznych
Reaction Prediction- wzorce są podstawą do przewidywania reakcji
danego rodzaju pary (lub par) chemicznych złożonych struktur w e-Zyme
oprogramowania. Ponadto, na podstawie obserwacji, że konkretne modele są
wyjątkowo RDM lub preferencyjnie w
szczególnych kategorii KEGG szlaki metaboliczne.
|