Pracownicy Katedry Geografii Społeczno-Ekonomicznej współpracują z krajowymi i międzynarodowymi organizacjami naukowymi i stowarzyszeniami zawodowymi. W szczególności należy tu wymienić takie organizacje jak: Polskie Towarzystwo Geograficzne, Komisja Krajobrazu Kulturowego PTG, Komitet Przestrzennego Zagospodarowania Kraju PAN, Polska Federacja Stowarzyszeń Rzeczoznawców Majątkowych, Towarzystwo Rozwoju Obszarów Wiejskich, Stowarzyszenie B-4 (badania podwodne), Ogólnopolskie Centrum Szkolenia Podwodnego Komisji Działalności Podwodnej Polskiego Towarzystwa Turystyczno-Krajoznawczego, Towarzystwo Naukowe Nieruchomości, Polska Asocjacja Krajobrazu, Stowarzyszenie Architektów Polskich, Warmińsko-Mazurska Okręgowa Izba Architektów, Stowarzyszenie Gospodarka Przestrzenna, Północna Okręgowa Izba Urbanistów w Gdańsku, Komisja Urbanistyczno-Architektoniczna Województwa Warmińsko-Mazurskiego, Towarzystwo Naukowe im. Wojciecha Kętrzyńskiego w Olsztynie.

Aktywność pracowników Katedry poza uczelnią to także pełnienie funkcji członków Rad Naukowych i recenzentów licznych czasopismach naukowych krajowych i międzynarodowych.

Współpraca na forum międzynarodowym rozwija się także poprzez staże naukowe, dydaktyczne oraz współpracę naukową oraz wymianę doświadczeń i wspólne publikacje z pracownikami następujących zagranicznych uniwersytetów i instytucji badawczych: Vilnius University – Litwa, Gothenburg University – Szwecja, University of Tartu – Estonia, University of Latvia – Łotwa, Nature Research Centre, Vilnius – Litwa, Federal University of Viçosa, Minas Gerais – Brazylia, Aristotle University of Thessaloniki – Grecja, West University of Timisoara – Rumania, University of Uppsala – Szwecja, University of Surrey - Wielka Brytania, Vietnam National University of Agriculture – Wietnam, Czernihowski Państwowy Instytut Ekonomiki i Zarządzania w Czernihowie – Ukraina.

Współpraca z ośrodkami naukowymi w Polsce: Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu, Politechnika Gdańska, Uniwersytet Śląski w Sosnowcu, Uniwersytet Łódzki, Uniwersytet Rolniczy w Krakowie.