Nowością w programie Horyzont Europa są misje stworzone w celu zwiększenia skuteczności finansowania poprzez dążenie do jasno określonych, wymiernych i inspirujących celów. MISJE powinny mieć wymierny cel w określonych ramach czasowych, muszą być ambitne ale realistyczne, opracowano je aby stymulować innowacje w różnych dyscyplinach. Skoncentrowano się na pięciu obszarach priorytetowych, którymi są:

  §  Nowotwory

Do 2030 r. uratowanych ma zostać ponad 3 miliony istnień ludzkich, ludzie mają żyć dłużej i lepiej. Cel ma zostać osiągnięty poprzez lepsze rozumienie nowotworów, poprawę profilaktyki, diagnozowania i leczenia, polepszenie jakości życia wszystkich osób zagrożonych rakiem, oraz zapewnienie równego dostępu do powyższego w całej Europie.

 §  Adaptacja do zmian klimatu, w tym transformacja społeczna

Do 2030 r. należy przygotować Europę do radzenia sobie z zaburzeniami klimatu; przyspieszyć przejście do zdrowej i dostatniej przyszłości w bezpiecznych granicach; oraz skalować rozwiązania w zakresie odporności, które inicjują transformacje społeczne.

 §  Zdrowe oceany, morza, wody przybrzeżne i śródlądowe

Do 2030 r. oczyszczanie wód morskich i słodkich, przywracanie zdegradowanych ekosystemów i siedlisk, dekarbonizacja „niebieskiej gospodarki” w celu zrównoważonego wykorzystania niezbędnych towarów i usług.

 §  Neutralne klimatycznie i inteligentne miasta

Wspieranie i promowanie 100 europejskich miast w ich transformacji systemowej w kierunku neutralności klimatycznej do 2030 r. i przekształcenie tych miast w ośrodki eksperymentów i innowacji.

 §  Zdrowa gleba i żywność

Do 2030 r. co najmniej 75% wszystkich gleb w UE ma być zdrowych i w stanie zapewnić niezbędne usługi w zakresie zdrowej żywności, ludzi, przyrody i klimatu.

 Jak widać MISJE UE to zobowiązanie do rozwiązania największych wyzwań stojących przed naszym światem, są też one spoiwem łączącym Horyzont Europa z innymi inicjatywami. Nie można ich osiągnąć za pomocą pojedynczych działań, konieczne jest realizowanie szeregu inicjatyw które przyczynią się do realizacji kluczowych priorytetów polityki UE, tj. Europejski Zielony Ład, Europejski Plan Walki z Rakiem, Zrównoważony Rozwój i wielu innych.